A Secretaria Geral é responsável pela gestão do Programa CYTED, sob a direção da Assembleia Geral. A Secretaria Geral inclui os órgãos de gestão técnica do CYTED, que são os Comités de Área, cada um liderado por um coordenador especializado em cada área de interesse do Programa.
O Coordenador de Área é nomeado pela Assembleia Geral por um período de dois anos, podendo ser reeleito uma vez. É igualmente constituída pelo Coordenador Científico e pela equipa técnica que presta apoio ao secretariado na sede localizada em Madrid (Espanha).
Secretário-geral
Luis Telo da Gama
2020-2022
Secretarios Generales Anteriores
2019 .- Oscar Manuel Cobar Pinto
2012 – 2018 .- Alberto Majó Piñeyrúa
2003 – 2012 .- Fernando Aldana Mayor
1998 – 2003.- José Antonio Cordero
1997 – 1998.- Horacio Díaz del Barco
1989 – 1996.- Jesús Sebastián Audina
1986 – 1989.- Manuel Casero Nuño
1984 – 1986.- Eduardo Lechuga Jiménez
Secretaría General
Responsable Gestión Económica
Pilar Moreno Escribano
Responsable Innovación y Logistica
María José Penas García
Responsable Comunicación e Imagen
Iván Molinero Recio