Logros

Manuscritos en revisión
1. “Bacterially produced GABA protects neurons from degeneration”. Manuscrito en revisión en Plos Biology. Puede accederse en: http://biorxiv.org/cgi/content/short/711887v1
Este trabajo muestra específicamente que las bacterias intestinales de C. elegans definen la velocidad de muerte neuronal. También identificamos metabolitos bacterianos en las bacterias neuroprotectoras. 
2. "Identification of modules with similar gene regulation and metabolic functions based on co-expression data" por E Galán-Vásquez, E Pérez-Rueda.
Se identificaron módulos metabólicos y de regulación a partir de datos de expresión global. Esperamos identificar aquellas rutas que estarían asociadas al metabolismo de nitrógeno.

Manuscritos publicados
1. Mauricio Caneo, Victoria Julian, Alexandra B. Byrne, Mark J. Alkema, Andrea Calixto. 2019. Diapause induces functional axonal regeneration after necrotic insult in C. elegans. PLoS Genetics.  https://doi.org/10.1371/journal.pgen.1007863.
En este articulo demostramos que la diapausa, un estado de inanición, promueve la reparación de los axones degenerados. Esto es de mucha importancia para el trabajo con los metabolitos bacterianos porque nos permite trazar paralelos entre el metabolismo en respuesta a la dieta y el metabolismo durante la falta de alimentos.
2. Escobar-Turriza P, Hernández-Guerrero R, Poot-Hernández AC, Rodríguez-Vázquez K, Ramírez-Prado J, Perez-Rueda E. 2019. Identification of functional signatures in the metabolism of the three cellular domains of life. PLoS One 14(5): e0217083.
En este trabajo evaluamos el repertorio enzimático asociado al metabolismo de diversos organismos e identificamos aquellas funciones que podrían estar conservadas en todos los organismos (bacterias, arqueas y eucariontes). El metabolismo es analizado a manera de módulos, donde mas de 100 de ellos son considerados.

Estudiantes graduados
Se graduó el alumno Emanuel Flores con el trabajo "Desarrollo de un método bioinformático basado en datos de microarreglos y RNA-seq para la predicción funcional de los factores de transcripción en Escherichia coli K-12 MG1655". El Dr. Flores es del grupo de Ernesto Perez Rueda (Mexico).

Participación en Congresos
1. Arles Urrutia and Andrea Calixto. Bacterially produced neurotransmitter protects neurons from degeneration. June 20th-24th. International C. elegans Meeting UCLA 2019 (charla).
2. Sebastian Urquiza, Arles Urrutia and Andrea Calixto. Natural microbiome of Chilean C. elegans isolates and their relationship with neuroprotection. June 20th-24th. International C. elegans Meeting UCLA 2019 (poster).
3. Pedro Escobar and Ernesto Perez Rueda " IDENTIFICATION OF FUNCTIONAL SIGNATURES IN THE METABOLISM OF PROKARYOTES AND EUKARYOTES" a realizarse en la Ciudad de Mexico de 8-10 de septiembre de 2019. "Biophys 2019" (poster).

Organizacion de Cursos
Small Brains Big Ideas (Las Cruces, Chile). Sitio web http://smallbrains.org/
Organización de congresos internacionales
2nd Latin American C. elegans Meeting, Rosario, Argentina. 19-21 de febrero. Sitio web https://lawm2020.webnode.es/

Viajes de la Red para estudiantes
1. Arles Urrutia realizo una estadia por un mes en el Instituto de Biologia Molecular de Rosario. Marzo-Abril (2019).
En este viaje Arles realizo las extracciones de metabolitos de las bacterias neuroprotectoras.
2. Sebastian Urquiza esta realizando una estadia por un mes en el Instituto de Biologia Molecular de Rosario. Septiembre (2019).
En este viaje Sebastian Urquiza esta realizando extracciones de metabolitos del microbioma natural de C. elegans en condiciones de neurproteccion.
Charlas de alta concurrencia
1. Andrea CalixtoBacterial dietary impact on neuronal repair in C. elegans”. Viernes 13 de Septiembre, IBR, Rosario Argentina
2. Andrea Calixto Catedras del Futuro https://www.umayor.cl/um/catedra-del-futuro/ NEUROPROTECCIÓN EN LA COMIDA: LECCIONES DE UN GUSANO Y SUS BACTERIAS